南開大學重點學科
一級學科國家重點學科6個（覆蓋35個二級學科）
數學：
含基礎數學、計算數學、概率論與數理統計、應用數學、運籌學與控制論5個二級學科
化學：
含無機化學、分析化學、有機化學、物理化學、高分子化學與物理5個二級學科
光學工程
理論經濟學：
含政治經濟史、經濟史、世界經濟、西方經濟學、人口資源與環境經濟學、經濟思想史6個二級學科
應用經濟學：
含區域經濟學、金融學、產業經濟學、國際貿易學、財政學、數量經濟學、國民經濟學、勞動經濟學、統計學、國防經濟10個二級科學科
歷史學：
含史學理論與史學史、考古學及博物館學、專門史、中國古代史、中國近代史、世界史、歷史地理學、歷史文獻學8個二級學科
其他二級學科國家重點學科9個
光學：
研究方向：光與物質相互作用的前沿問題、先進光學與光子學材料制備及其性能、光學與光子學器件及其物理機制
動物學：
研究方向：動物系統學、動物生理生化、動物分子生物學、動物免疫學
微生物學：
研究方向：微生物功能基因組學與生物信息學、分子病毒學、現代真菌學和資源細菌學
環境科學：
研究方向：環境化學與受污染環境修復、城市空氣顆粒物污染防治、水資源高效利用與污染控制、環境管理與經濟
農藥學：
研究方向：綠色農藥分子設計及合成，天然源農藥的研究，快速、靈敏、微量的新農藥篩選模型的建立及應用
馬克思主義哲學：
研究方向：當代馬克思主義哲學、馬克思主義社會政治哲學、馬克思主義社會政治哲學等
政治學理論：
研究方向：中國政府與政治、政治學理論與方法、比較政治、國際關系理論與區域政治、政黨政治等
中國古代文學：
研究方向：古代文學思想史、小說史與小說理論批評、古代文學與宗教文化等
企業管理：
研究方向：公司治理、服務管理、創業與中小企業研究等